Phylogenetic study of H5 low pathogenic avian influenza viruses detected in wild birds in Poland in 2010-2015.

Opis bibliograficzny

Phylogenetic study of H5 low pathogenic avian influenza viruses detected in wild birds in Poland in 2010-2015. [AUT.] ŚMIETANKA KRZYSZTOF, ŚWIĘTOŃ EDYTA. Journal of Veterinary Research (Poland). DOI: 10.1515/jvetres-2017-0054
Skopiowane!
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Rok:2017
Język:angielski
Charakter formalny:Artykuł w czasopismie
Typ MNiSW/MEiN:inne

Streszczenia

Introduction: The genomes of nine H5 subtypes of low pathogenic avian influenza virus (LPAIV) strains identified in wild birds in Poland between 2010 and 2015 were sequenced, and their phylogenetic relationship was determined. Material and Methods: AIV genome segments were amplified by RT-PCR and the PCR products were sequenced using Sanger method. Phylogenetic trees were generated in MEGA6 software and digital genotyping approach was used to visualise the relationship between analysed strains and other AIVs. Results: High genetic diversity was found in the analysed strains as multiple subgroups were identified in phylogenetic trees. In the HA tree, Polish strains clustered in two distinct subclades. High diversity was found for PB2, PB1, PA and NP, since 5-8 sublineages could be distinguished. Each strain had a different gene constellation, although relationship of as much as six out of eight gene segments was observed between two isolates. A relationship with poultry isolates was found for at least one segment of each Polish strain. Conclusion: The genome configuration of tested strains indicates extensive reassortment, although the preference for specific gene constellation could be noticed. A significant relationship with isolates of poultry origin underlines the need for constant monitoring of the AIV gene pool circulating in the natural reservoir.

Open Access

Tryb dostępu:otwarte czasopismoWersja tekstu:ostateczna wersja opublikowanaLicencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa - Użycie niekomercyjne - Bez utworów zależnych (CC-BY-NC-ND) Czas udostępnienia:w momencie opublikowania

Identyfikatory

ISSN: 2450-7393
e-ISSN: 2450-8608
BPP ID: (7, 8421) wydawnictwo ciągłe #8421

Metryki

20,00
Punkty MNiSW/MEiN
0
Impact Factor
0
Index Copernicus
0
Punktacja wewnętrzna

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Skopiowane!

Informacje dodatkowe

Status:przed korektą
Praca recenzowana:nie
Rekord utworzony:2 kwietnia 2025 01:20
Ostatnia aktualizacja:2 kwietnia 2025 01:20