Comparison of serological and molecular methods for differentiation between genotype A and genotype B strains of small ruminant lentiviruses.

Opis bibliograficzny

Comparison of serological and molecular methods for differentiation between genotype A and genotype B strains of small ruminant lentiviruses. [AUT.] OLECH MONIKA, KUŹMAK JACEK. Journal of Veterinary Research (Poland). DOI: 10.2478/jvetres-2024-0025
Skopiowane!
Kliknij opis aby skopiować do schowka

Szczegóły publikacji

Rok:2024
Język:angielski
Charakter formalny:Artykuł w czasopismie
Typ MNiSW/MEiN:inne

Streszczenia

Introduction: Small ruminant lentiviruses (SRLV) cause multisystemic, degenerative and chronic disease in sheep and goats. There are five genotypes (A, B, C, D and E), of which A and B are the most widespread. The purpose of this study was to evaluate the serotyping efficiency of the Eradikit SRLV Genotyping ELISA and the molecular typing efficiency of a newly developed nested real-time PCR targeting the long terminal repeat–gag (LTR-gag) region using samples from animals infected with subtypes of SRLV known to circulate in Poland. Material and Methods: A total of 97 sera samples taken from 34 sheep and 63 goats were immunoassayed, and 86 DNA samples from 31 sheep and 55 goats were tested with the PCR. All ruminants were infected with known SRLV strains of the A1, A5, A12, A13, A16, A17, A18, A23, A24, A27, B1 and B2 subtypes. Results: A total of 69 (80.2%, 95% confidence interval 71.6%–88.8%) out of 86 tested samples gave positive results in the PCR. In 17 out of the 86 (19.8%) samples, no proviral DNA of SRLV was detected. The differentiation between MVV (genotype A) and CAEV (genotype B) by PCR matched the predating phylogenetic analysis invariably. No cross-reactivity was observed. On the other hand, the proportion of samples genotyped the same by the older phylogenetic analysis and the Eradikit SRLV Genotyping ELISA was 42.3%. The test was unable to classify 40.2% of samples, and 17.5% of sera were incorrectly classified. Conclusion: Our results showed that the Eradikit SRLV genotyping kit is not a reliable method for predicting SRLV genotype, while the nested real-time PCR based on the LTR-gag region did prove to be, at least for genotypes A and B.

Open Access

Tryb dostępu:otwarte czasopismoWersja tekstu:ostateczna wersja opublikowanaLicencja: Creative Commons - Uznanie Autorstwa - Użycie niekomercyjne - Bez utworów zależnych (CC-BY-NC-ND) Czas udostępnienia:w momencie opublikowania

Identyfikatory

ISSN: 2450-8608
BPP ID: (7, 8770) wydawnictwo ciągłe #8770

Metryki

140,00
Punkty MNiSW/MEiN
0
Impact Factor
0
Index Copernicus
0
Punktacja wewnętrzna

Eksport cytowania

Wsparcie dla menedżerów bibliografii:
Ta strona wspiera automatyczny import do Zotero, Mendeley i EndNote. Użytkownicy z zainstalowanym rozszerzeniem przeglądarki mogą zapisać tę publikację jednym kliknięciem - ikona pojawi się automatycznie w pasku narzędzi przeglądarki.

Skopiowane!

Informacje dodatkowe

Status:przed korektą
Praca recenzowana:nie
Rekord utworzony:2 kwietnia 2025 01:21
Ostatnia aktualizacja:17 listopada 2025 08:04